Lampedusa si trova a 61 km dalla Sicilia ed è bagnata dal Mar Mediterraneo; con Linosa, abitata e di natura vulcanica, e Lampione, queste isole costituiscono l´arcipelago delle Pelagie, le antiche Pelaghie, o isole d´alto mare.

Lampedusa si trova su una piattaforma che, fino alla Tunisia, non supera i 100 metri di profondità. Nei suoi ricchi fondali si può ammirare una fauna tropicale grazie alla sua vicinanza alla coste africane.

Lampedusa fu scoperta negli anni sessanta da alcuni subacquei alla ricerca di fondali tropicali prossimi a casa: flora e fauna marina sono infatti simili a quelle della vicina Africa sulla cui piattaforma l´isola poggia.

Questi fondali sono la maggiore attrattiva turistica di Lampedusa e giustificano ampiamente il lungo spostamento via mare da Porto Empedocle o via aerea da Palermo e dalle altre località del centro e del nord Italia.

A Lampedusa è stata istituita una riserva naturale "dell´isola dei Conigli" e delle zone adiacenti, per proteggere le tartarughe e le loro uova, che ogni estate vengono a depositare sulle spiaggie bianche dell´isola dei Conigli.